Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ass1P16460 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ass1P16460 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ass1P16460 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ass1P16460 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ass1P16460 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ass1P16460 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ass1P16460 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ass1P16460 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ass1P16460 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ass1P16460 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms