Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb1P14733 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmnb1P14733 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb1P14733 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms