Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Dnmt1P13864 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt1P13864 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms