Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Schip1P0DPB4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms