Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CatspereP0DP43 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms