Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd3P09027 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms