Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NefmP08553 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NefmP08553 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NefmP08553 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NefmP08553 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NefmP08553 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NefmP08553 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NefmP08553 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NefmP08553 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NefmP08553 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NefmP08553 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NefmP08553 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NefmP08553 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefmP08553 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefmP08553 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefmP08553 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefmP08553 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefmP08553 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefmP08553 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefmP08553 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefmP08553 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefmP08553 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefmP08553 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefmP08553 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefmP08553 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefmP08553 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefmP08553 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NefmP08553 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NefmP08553 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NefmP08553 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NefmP08553 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefmP08553 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefmP08553 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefmP08553 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms