Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApoeP08226 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApoeP08226 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms