Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a2P08122 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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