Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnfP06804 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnfP06804 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnfP06804 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnfP06804 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnfP06804 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnfP06804 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TnfP06804 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnfP06804 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnfP06804 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnfP06804 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnfP06804 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnfP06804 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnfP06804 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnfP06804 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnfP06804 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnfP06804 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnfP06804 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms