Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-Eb1P04230 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms