Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01735 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01735 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01735 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01735 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01735 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01735 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01735 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01735 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01735 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01735 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01735 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01735 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01735 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01735 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01735 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01735 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms