Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01668 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01668 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01668 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01668 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01668 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01668 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms