Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01656 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01656 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01656 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01656 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01656 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01656 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01656 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01656 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01656 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01656 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms