Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01638 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01638 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01638 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01638 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01638 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01638 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01638 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01638 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01638 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01638 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01638 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01638 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01638 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01638 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01638 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01638 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01638 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01638 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01638 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01638 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01638 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms