Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tom1O88746 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tom1O88746 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms