Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sap30O88574 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sap30O88574 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sap30O88574 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sap30O88574 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sap30O88574 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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