Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms