Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3aO88508 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3aO88508 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms