Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl22O88430 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl22O88430 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl22O88430 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccl22O88430 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl22O88430 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl22O88430 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl22O88430 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl22O88430 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl22O88430 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl22O88430 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl22O88430 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl22O88430 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl22O88430 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl22O88430 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl22O88430 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl22O88430 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl22O88430 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl22O88430 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl22O88430 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl22O88430 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl22O88430 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl22O88430 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms