Protein–RNA interactions for Protein: O70494

Sp3, Transcription factor Sp3, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp3O70494 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp3O70494 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp3O70494 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp3O70494 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sp3O70494 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sp3O70494 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sp3O70494 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms