Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb5O70309 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb5O70309 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb5O70309 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb5O70309 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb5O70309 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb5O70309 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb5O70309 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb5O70309 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb5O70309 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb5O70309 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb5O70309 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb5O70309 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms