Protein–RNA interactions for Protein: O70194

Eif3d, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3dO70194 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3dO70194 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3dO70194 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms