Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alx3O70137 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alx3O70137 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alx3O70137 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms