Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RngttO55236 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RngttO55236 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RngttO55236 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RngttO55236 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RngttO55236 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms