Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp26a1O55127 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp26a1O55127 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms