Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarce1O54941 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarce1O54941 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms