Protein–RNA interactions for Protein: O54863

Tssk2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk2O54863 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssk2O54863 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms