Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a2O54833 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms