Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CrxO54751 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CrxO54751 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CrxO54751 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CrxO54751 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CrxO54751 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CrxO54751 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CrxO54751 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CrxO54751 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CrxO54751 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CrxO54751 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CrxO54751 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CrxO54751 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CrxO54751 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CrxO54751 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CrxO54751 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CrxO54751 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms