Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pik3cdO35904 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms