Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npc1O35604 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms