Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf5O35445 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rnf5O35445 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rnf5O35445 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rnf5O35445 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnf5O35445 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf5O35445 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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