Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms