Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dgcr6O35347 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dgcr6O35347 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms