Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms