Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2O35245 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms