Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms