Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarb2O35114 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms