Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap23O09044 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap23O09044 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap23O09044 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snap23O09044 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms