Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5294J3QP53 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms