Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21060J3KMU4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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