Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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