Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms