Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc4lG5E8X2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms