Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r12G5E8G1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms