Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
2610008E11RikG3X964 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms