Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd5G3UW60 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms