Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms