Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colca2F8VPY8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms